玉米6K基因分型芯片
康普森玉米6K基因分型芯片是是一款中等密度育種芯片，由康普森生物和中國農業科院作物科學研究所聯合開發，通過Illumina 和 Thermo Fisher 平臺定制完成的一款玉米育種芯片產品，既可以研究溫帶材料又有效于熱帶材料的分子育種研究。
位點信息：5,179個位點，24制式/384制式
Array Characteristics
芯片特點
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適用性廣
溫帶和熱帶材料分布無顯著差異的SNP 標記占比高達2/3 -
覆蓋度高
含2,200 多個調控功能基因表達的重要候選標記 -
功能標記
涵包含部分玉米油分、抗旱和抗病的功能標記 -
均勻覆蓋
全基因組均勻覆蓋，基因密度高的區段加設標記
Result display
結果展示 ? ?
提高玉米種子在低溫下的出苗能力是一個非常重要的育種目標。該研究利用4 個低溫發芽能力不同的親本構建了3 個F2:3 群體， 通過玉米6K 芯片獲得基因分型，利用2,693 個SNP 標記構建一致性遺傳連鎖圖譜，在10℃鑒定5 個低溫出苗能力相關表型，QTL 定 位結果獲得43 個QTL 和３個Meta-QTL（mQTL），這些結果為在mQTL 區域內克隆基因及發現玉米種子萌發過程的耐寒性分子機 制提供了基礎。
圖1 三個群體的低溫發芽相關性狀檢測到的QTL
表1 通過一致性連鎖圖譜檢測到的Meta-QTL (mQTL)
參考文獻：Li X, Wang G, Fu J, et al . QTL Mapping in Three Connected Populations Reveals a Set of Consensus Genomic Regions for Low Temperature Germination Ability in Zea mays L. Front. Plant Sci . 2018.
Application scenario
芯片應用場景 ? ?
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保種育種應用 /Conservation breeding applications ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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分子標記輔助育種品種鑒定親緣關系鑒定 -
基礎科研 /Basic research ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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QTL定位重要標記篩選
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